Предиктивная 100-генная шкала. Анализ диагностической эффективности при метастатическом раке молочной железы
Палтуев Р.М., Алексахина С.Н., Артемьева А.С., Байчоров Э.А., Бахарев С.Ю., Божок А.А., Васин В.А., Владимиров В.И., Волынщикова О.А., Воронцов А.Ю., Гайсина Е.А., Гофман А.А., Имянитов Е.Н., Клименко В.В., Комяхов А.В., К
Опухоли женской репродуктивной системы. 2023;19(1):69-81. https://doi.org/10.17650/1994-4098-2023-19-1-69-81
Введение. Рак молочной железы (РмЖ) – наиболее часто встречающееся онкологическое заболевание в женской популяции. Молекулярные методики оценки генетического профиля опухоли позволяют более точно изучить свойства опухоли индивидуально, выявить новые прогностические и предиктивные маркеры.
Цель исследования – повысить эффективность системной терапии РмЖ, снизить количество необоснованных назначений с помощью данных об индивидуальных молекулярно-генетических характеристиках опухоли, разработать мультигенную панель для обеспечения персонализированного подхода к назначению системного лечения РмЖ.
Материалы и методы. В рамках исследования в образцах опухолевой ткани (всего 84 образца) пациенток пре- и постменопаузального возраста с метастатическим РмЖ, которые наблюдались и получали лечение в 6 медицинских учреждениях, изучена экспрессия мРНК 100 генов, участвующих в развитии РмЖ. Предварительно в качестве тестового исследования был проведен анализ архивного материала из парафиновых блоков опухолей 12 пациенток из 1216 больных с T1–2N0M0 РмЖ, включенных в ретроспективный анализ. Анализ экспрессии генов проводили с использованием технологии nCounter, основанной на прямой цифровой детекции мишеней с помощью флуоресцентных штрих-кодов (nCounter Analysis System компании NanoString Technologies, США). Исследуемым материалом являлись образцы опухолевой ткани (биоптаты или операционный материал). Выбор генов основан на результатах изучения данных литературы и опыта разработки других мультигенных структур, а также клинической значимости маркеров прогностических шкал. исследования с целью подтверждения мутации генов проводили методами секвенирования нового поколения и полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией.
Результаты. Выполнен анализ экспрессии 28 генов с высокой предиктивной значимостью и значительным накопленным опытом изучения по данным литературы (ESR1, PGR, PIK3CA, BCAR4, BCAS2, CCND1, CCND2, CCND3, FOXA1, Erb2, EGFR, CDH3, FOXC1, KRT14, KRT5, CD274, CDK4, CDK6, P53, PTEN, BRCA1, BRCA2, CHEK2, CLDN3, CLDN7, AR, TOP2a, TUBBIII). По результатам сравнения было выявлено 29 случаев (29 / 84; 34,5 %) расхождения в оценке подтипа опухоли. В 11 случаях расхождения относились к люминальным а и В подтипам РмЖ, что может оказать влияние на выбор оптимальной лекарственной терапии. В 18 случаях расхождения относились к подтипам опухоли РмЖ, для которых рекомендуются принципиально различные схемы лекарственной терапии. Разработанная мультигенная сигнатура в рамках одного лабораторного исследования обеспечивает точное определение подтипа опухоли у пациенток с метастатическим РмЖ и выбор оптимальной тактики лекарственной терапии.
Заключение. Разработанная 100-генная сигнатура включает молекулярные подтипы РмЖ (люминальный а, люминальный В, базальный, клаудиноподобный) и лечебно-ориентированные кластеры. Молекулярно-генетическое профилирование опухоли с использованием данной мультигенной сигнатуры является точным методом определения подтипа опухоли у пациенток с РмЖ, что определяет возможность индивидуализации тактики лекарственной терапии.